قام اليوم نيافة الحبر الجليل الأنبا كيرلس أفامينا رئيس دير الشهيد العظيم مارمينا العجايبي بصحراء مريوط بالأسكندرية والأباء الرهبان بالدير بتطيب رفات مثلث الرحمات البابا كيرلس السادس في تذكار نياحته 9 مارس وذلك بمزار البابا كيرلس بالدير الجدير بالذكر أن يوم نياحه البابا كيرلس
أستقبل عدداً من أبنائه وعند خروج أخر واحد وكان كاهناً – رفع الصليب وقال ” الرب يدبر أموركم ” ودخل قلايته وأستودع روحه بيد الله الذي خدمه في 9 مارس 1971 ودفن تحت مذبح الكاتدرائية التي أنشأها، وفي 15 هاتور 1677 ش الموافق 25نوفمبر 1972 م نقل جسده في احتفال مهيب إلي دير الشهيد مارمينا بمريوط حسب وصيته ليكون بجوار شفيعه مارمينا. و في يوم الخميس الموافق 20 يونيو2013 م، اجتمع المجمع المقدس للكنيسة القبطية الأرثوذكسية برئاسة قداسة البابا الانبا تواضروس الثاني ، و تم الاعتراف بقدسية البابا كيرلس السادس ، وذلك بعد مرور 43 عاماً على نياحته ، و بناء على هذا القرار يمكن بناء الكنائس على اسمه ، بالاضافة إلى امكانيه ذكره في مجمع القديسين الموجود في كلا من الخولاجى المقدس (كتاب صلوات القداس الالهى) و الابصلمودية المقدسة (كتاب التسبحة).