خلال زيارته الرعوية لمصر توجة قداسة البطريرك مار إغناطيوس أفرام الثاني لكنيسة القديسين مار بطرس ومار بولس بالقاهرة. رافق قداسته أصحاب النيافة المطارنة: “مار تيموثاوس متى الخوري مطران حمص وحماة وطرطوس وتوابعها والنائب البطريركي بالوكالة في مصر، مار يوسف بالي السكرتير البطريركي ومدير دائرة الإعلام “.
كما زار قداسته المقابر التابعة للكنيسة والى يتم جديدها الآن؛ وهناك صلى قداسته صلاة القديسين و الراقدين.
وكان قداسته قد زار كنيسة كنيسة ماربهنام وأخته سارة “فم الخليج” بالقاهرة ، كما أقام قداسته صلاة خدمة القديسين وزار قداسته الكنائس الأثرية بدير مارمينا.
ويذكر أن قداسته قد زار أمس كنيسة السيدة العذراء مريم وصلي قداسته صلاة الشكر.