تعد كنيسة القديس العظيم الأنبا انطونيوس بالسويس من أقدم الكنائس بإيبارشية السويس، والتي تأسست يوم 30 أغسطس عام 1897.
شيدت كنيسة الأنبا أنطونيوس في عهد قداسة الأنبا كيرلس الخامس البابا الـ 112 و نيافة الأنبا باسيليوس الكبير مطران الكرسي الأورشليمي والشرق الأدنى والدقهلية ودمياط والشرقية ومدن القناة وبعض بلاد الغربية، وفي يوم الأحد الموافق 30 أغسطس 1897 تم تكريسها باسم السيدة العذراء مريم و القديس الأنبا أنطونيوس أب الرهبان، و كانت مساحتها أقل بكثير من مساحة الكنيسة حاليا .
و في عام 1948 في عهد قداسة البابا يوساب الثاني البابا الـ 115 و نيافة الأنبا متاؤس مطران كرسي الشرقية و مدن القناة تم بناء الكنيسة الحالية و تكريسها و الصلاة فيها، و تحتوي على المذبح الرئيسي باسم السيدة العذراء و المذبح البحري باسم القديس الأنبا أنطونيوس و المذبح القبلي باسم الشهيد العظيم مارجرجس .
تحتفل إيبارشية السويس في أغسطس المقبل بمرور 122 عاما على تأسيس كنيسة القديس العظيم الأنبا انطونيوس .