أثارت المفاضلة فى توزيع 200 وظيفة شاغرة بمختلف فروع جامعة أسيوط والوادى الجديد مؤخرا جدلا واسعاً بشأن عدم ألتزام ادارة جامعة أسيوط بالضوابط والشروط والمواد القانونية التى تنظم أمر شغل هذة الوظائف . وكانت جامعة أسيوط فى الفترة الاخيرة قد أصدرت العديد من قرارات التعين لعدد من رؤساء اقسام الكليات والمدرسين بمختلف كليات جامعة أسيوط و الوادى الجديد . ولاقى توزيع غنائم وظائف الجامعة فى الفترة الاخيرة لغطاً كبيراً من حيث التشكك فى حيادية ادارة الجامعة والقائمين على الاشرف على اجراءات تسير الاعلانات . وقد اعربت ادارة جامعة أسيوط عن استياءها الشديد بشأن هذا اللغط .
وبناء على ذلك فقد قرر الدكتور محمد عبد السميع عيد رئيس الجامعة ترك المجال لمحافظة الوادي الجديد لاختيار الوظائف المعلن عنها وذلك بمعرفتها وعن طريقها مع تحملها المسئولية الإجرائية والقانونية المنظمة لذلك،حيث إنه من المقرر أن يتم تسليم المحافظة ملفات وأوراق المتقدمين لشغل تلك الوظائف لفحصها والمفاضلة بينهم وفقاً للقواعد والضوابط التى حددتها وزارة المالية في هذا الشأن وذلك من خلال اللجنة المذكورة بالصحف ودون تدخل من إدارة الجامعة .