أصدر مركز ابن خلدون تقريرا حول انتهاكات الإخوان المسلمين و انصارهم منذ 30 يونيو وحتى إعلان الإخوان جماعة إرهابية وأوضح التقرير أن إجمالي عدد الإعتداءات علي المنشئات الحكومية 65 إعتداء وعدد المصابين جراء عنف جماعة الإخوان الإرهابية 1740 بينما توفي 124 مصري نتيجة العنف المتواصل منذ 30 يونيو الماضي.
وقالت داليا زيادة المدير التنفيذي اننا نقوم بهذا الرصد بشكل دوري منذ 30 يونيو تمهيداً لوضعه في مذكره مدعمة بالوثائق لتقديمها للولايات المتحدة والإتحاد الاوربي للضغط عليهم لإدراج جماعة الإخوان المسلمين علي قائمة التنظيمات الإرهابية لديهم.
بدأت هذه المرحلة من 30 يونيو إلي ما قبل فض الإعتصام، واتسمت هذه المرحلة بإنتشار بعض التصريحات التي تحض على ممارسة العنف كانت بدايتها تصريحات مستشار الرئيس لصحيفة الوطن بتاريخ 2-7-2013 والتي قال فيها “مرسي لن يستقيل وسنحمي شرعيته برقابنا”، ثم عقبها العديد من التصريحات لقيادات جماعة الإخوان الإرهابية والتي تحض علي ممارسة العنف بالتزامن مع أحداث عنف وقعت بالفعل في بعض محافظات مصر. ذلك فيما قبل فض الإعتصام والتي شملت 82 قتيل أثناء الإشتباكات و 3 قتلي عمد و22 حالة تعذيب حتي الموت و44 حالة تعذيب واعتداء.
ثم بدأت المرحلة الثانية عقب فض الاعتصام وبدأت هذه المرحلة منذ الساعات الأولى لفض الإعتصامين في 14 أغسطس 2013 وحتى ال7 أيام التي تلت الفض (20 أغسطس 2013)، وأستهدف أعضاء جماعة الإخوان الارهابية في هذه المرحلة المنشأت العامة والشرطية والكنائس كنوع من أنواع رد الفعل علي فض الإعتصامين.
ثم من 20 أغسطس 2013 بعد فض الاعتصامين والاحداث اللتي تلتهما إلي 25 ديسمبر 2013 يوم إعلنت فيه رسميا جماعة الإخوان المسلمين جماعة إرهابية، واتسمت هذه المرحلة بالمظاهرات والإحتجاجات التي كانت في أغلبها تنتهي باشتباكات، كما تسببت هذه المظاهرات في تعطيل سير الحياة عن طريق محاولات تعطيل الدراسة في الجامعات، وكذلك محاولة شلل القاهرة الكبرى بتعطيل خطوط المترو.