تقوم جمعية المحافظة علي التراث المصري بالتعاون مع المجلس الأعلي للآثار وبالتنسيق مع بطريركية الأقباط الأرثوذكس بتنفيذ المرحلة الأولي لتوثيق وتسجيل التراث القبطي,والتي تشتمل علي التوثيق المعماري للكنائس والأديرة الأثرية المسجلة وغير المسجلة ضمن الآثار ومحتوياتها من معادن ومنسوجات وغيرها,وكذلك المنازل والجبانات القبطية.
تتضمن أعمال المرحلة الأولي أيضا توثيق العناصر الفنية كالزخارف والنقوش والمخطوطات والأيقونات,وتوثيق التراث غير المادي كالموسيقي والعادات والتقاليد ومظاهر الاحتفالات الشعبية.
يدير المشروع الدكتور لؤي محمود سعيد أستاذ الآثار بجامعة القاهرة,ويقوم بالإشراف العلمي لتنفيذ التوثيق الأستاذ الدكتور حجاجي إبراهيم رئيس قسم الآثار بجامعة طنطا.صرح بذلك المهندس ماجد الراهب رئيس جمعية المحافظة علي التراث المصري.